La composizione, della durata di tre anni, prevede una rappresentanza interministeriale dei dicasteri della salute, dello sviluppo economico, delle politiche agricole e dell'ambiente; in particolare: il direttore del segretariato nazionale della valutazione del rischio della catena alimentare, il direttore della direzione generale della sicurezza degli alimenti e della nutrizione, direttore della direzione generale della sanita' animale e del farmaco veterinario, il direttore della direzione generale della prevenzione sanitaria e un rappresentante per ciascuno degli altri ministeri coinvolti. La Conferenza Stato Regioni dovrà designare sette rappresentanti regionali.
E' poi previsto un rappresentante per ciascuna delle Associazioni dei consumatori ed utenti presenti nell'elenco istituito presso il
ministero dello Sviluppo economico e un numero equivalente di rappresentanti delle associazioni dei produttori designati dal Cnel Alle riunioni della Consulta possono essere invitati a partecipare esperti nelle materie inserite all'ordine del giorno. La Consulta potrà inoltre articolare i propri lavori per tavoli tematici.